Pirmoji bažnyčia pastatyta 1511
m. Seniškyje (4 km į šiaurę nuo Naujojo
Daugėliškio), įsteigta parapija. Vėliau ši bažnyčia tapo
Daugėliškio parapijos filija. Seniškis buvo klebonijos
palivarkas. Jame 1776 m. pastatyta nauja bažnyčia. Ji 1915 m. sudegė.
Po Pirmojo pasaulinio karo atstatyta.
Albertas
Vaitiekus Goštautas 1526 m. Senajame
Daugėliškyje (3 km į pietus nuo Naujojo Daugėliškio) pastatė
parapinę bažnyčią. 1600 m. pastatyta nauja.
1808 m. bažnyčiai priklausė šie kaimai: Janionys,
Liekiai, Ožionys,
Pročiūnai.
Bažnyčia remontuota, 1812 m. atstatyta. 1851 m. išpuošta, pristatytos dvi šoninės koplyčios.
1886 m. bažnyčia sudegė. Suprojektuota
nauja mūrinė (sąmatinė vertė 36 471 rb). Leidimo jai statyti valdžia nedavė.
Teko vėl statyti medinę. Ji 1889 m.
pastatyta Naujajame Daugėliškyje. Statyba
rūpinosi 1885–1890 m. klebonavęs Jonas Burba (1853–1915). Jis išmokė
parapijiečius lietuviškai melstis, žadino jų tautinę sąmonę, platino draudžiamą
lietuvišką spaudą. Po Pirmojo pasaulinio karo veikė „Ryto“
draugijos mokykla. 1929–1936 m. – Šv.
Kazimiero draugijos skyrius.